Penentang RUU tersebut mengatakan bahwa RUU tersebut eksklusif dan melanggar prinsip-prinsip sekuler yang diabadikan dalam konstitusi. Mereka mengatakan iman tidak bisa dijadikan syarat untuk menjadi warga negara.
Konstitusi melarang diskriminasi agama terhadap warga negaranya, dan menjamin persamaan di depan hukum dan perlindungan hukum yang sama bagi semua orang.
Pengacara yang berbasis di Delhi, Gautam Bhatia, mengatakan bahwa dengan membagi tersangka migran menjadi Muslim dan non-Muslim, RUU tersebut “secara eksplisit dan terang-terangan berupaya untuk memasukkan diskriminasi agama ke dalam undang-undang, bertentangan dengan etos konstitusional sekuler kita yang sudah lama ada”.
Sejarawan Mukul Kesavan mengatakan RUU tersebut “dibungkus dalam bahasa perlindungan dan tampaknya ditujukan kepada orang asing, namun tujuan utamanya adalah untuk mendelegitimasi kewarganegaraan umat Islam”
